Инновационный научно-образовательный центр «ИРИДИЙ» имеет в своем составе 5 лабораторий: «Лаборатория радионавигации», «Лаборатория радиолокации», «Совместное с ОАО «Информационные спутниковые системы» им. Академика М.Ф. Решетнева лаборатория бортовой аппаратуры межспутниковых измерений (БАМИ) наземной станции космического управления (МСКУ)», «Лаборатория радиофизики», «Лаборатория медицинской электроники», а также «Студенческое конструкторское бюро»